一是严把程序关，突出依法性。制定检查方案，明确检查范围、内容、方式等事项。将相关法律法规依据、检查内容、检查单位名单、廉政监督电话等内容通过政府公开网、财政门户网发布检查公告，送达财政检查通知书，增加检查工作的透明度。
二是严把协作关，突出科学性。提前了解被检查单位基本情况，综合考虑单位各方因素，科学安排检查时间。将会计信息质量检查与部门预算编制执行、“小金库”治理、专项资金检查、绩效监督、财政票据管理等进行整合检查，使检查深入、细致、高效，切实为被检查单位减负。
三是严把处理关，突出实效性。就检查发现的问题与单位交换意见，提出整改建议。按程序出具书面检查报告，依据相关法律法规提出处理意见，及时以书面形式将违法违纪事实抄送有关部门。
四是严把整改关，突出督导性。坚持“整顿、规范、服务”的原则，针对存在的问题，指定专人负责对被查单位处理处罚决定执行情况进行跟踪落实，共同制定整改方案，督促被查单位及时整改。实行跟踪“回头看”，做到了处罚决定执行率、整改率均达到百分之百。
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